Archive for January, 2007

Edição de imagens, scientist mode

Monday, January 29th, 2007

Como eu mencionei em um post anterior, estou trabalhando bastante com microscopia e imagens digitais. Claro que fui procurar o quanto possível por um software de manipulação de imagens que fosse o melhor possível, ainda mais com meu professor oferecendo para comprar o que fosse necessário.

Após conversar com várias pessoas e procurar muito, o consenso que o melhor software é o tal ImageJ. Vale a pena entrar na página do ImageJ e perceber que ele foge do tradicional: a página é tosca, o software é em Java. Mas simplesmente funciona, e funciona muito bem. Alem do que, a comunidade faz plugins à beça, que realmente funcionam e são baseados em teorias matemáticas publicadas. E, acredite se quiser, roda muito rapidamente.

Pois é, o Photoshop não resolve quando o negócio é manipular imagens deste tipo. Estou aprendendo a usar o ImageJ e estou cada vez mais descobrindo como a ferramenta é poderosa.

Um pouco do que faço

Sunday, January 28th, 2007

Acho que a maioria dos que me lêem (todos os 5), sabem que sou médico, e que estou me especializando em Oncologia. Talvez o que não saibam é o tipo de pesquisa que estou fazendo. Meu trabalho no laboratório ocupa 90% da minha carga horária, e envolve pesquisa em câncer de pulmão. Estamos trabalhando em alguns genes que podem ser inibidos por medicamentos, em estágio experimental.

Mas uma técnica que estou usando há pouco tempo é realmente fantástica. Microscopia confocal é um tipo de microscópio que permite que se visualizem fatias ultra-finas de objetos, sem que o que esteja na frente ou atrás do objeto interfira demasiadamente na imagem final. Uma boa comparação é entre um exame de raio X e uma tomografia, na tomografia temos “cortes” axiais em que podemos visualizar com muito mais detalhes as estruturas no interior do objeto de interesse. O microscopio é inteiramente controlado por computador, e eu posso por exemplo pedir para gerar uma varredura de várias fatias, distantes menos de 1 µm entre si, e processar estas imagens para gerar projeções em 3-D.

Abaixo uma idéia do que eu vejo no microscopio. O verde é uma proteína que foi alterada geneticamente para produzir uma molécula que “brilha”, e em vermelho é o núcleo da célula. Tudo isto é fluorescente, e a excitação destas moléculas fluorescentes é feita por um laser de argônio, tudo isto com as células vivas.


Quando eu tiver tempo quero postar mais sobre isto no Meio Bit.

5 coisas que me irritam

Sunday, January 21st, 2007

Convidado pelo Aldemir, quase 10 dias depois eu entro na dança, e escrevo o que me irrita. Acho que de uma década para cá eu passei a ser muito mais paciente e a controlar melhor o que me irrita. Mas mesmo assim, há coisas que me irritam:

1 – Pressão: talvez um pouco diferente de irritação, eu fico ansioso quando sou pressionado, por exemplo quando há vários pacientes aguardando para serem vistos. Acho que isto é algo que vai passar também, mas é algo que me incomoda, pois eu passo a pensar no quanto os pacientes esperam para serem vistos, às vezes horas a fio.

2 – Falta de respeito pelo meu tempo: odeio quando por exemplo alguem me bipa, e o telefone indicado no pager ou não é respondido, ou pior, quando está ocupado. Ora, alguem me interromper eu entendo, muita gente precisa falar comigo imediatamente, mas me bipar e ficar no telefone enquanto espera que o otário retorne a ligação ?

3 – Falta de produtividade, minha. Isso é algo que me irrita bastante, apesar de parecer que produzo bastante, eu acho que muitas vezes eu passo horas e não faço nada. Fico rodando pelos feeds, pelo email, e não resolvo nada. Quando resolvo fazer alguma coisa no laboratorio, passo várias horas sendo extremamente produtivo, mas isso é algo que tem que se tornar praxe.

Nao tenho 5 itens. Posso considerar transito, barulho, o que for. Mas é algo que eu com o tempo me acostumei, e tolero numa boa. Acho que isso é parte de ficar velho :-)

Não vou indicar ninguem para continuar o meme. Já deu o que tinha que dar.

powered by performancing firefox

Arrumado RSS

Saturday, January 20th, 2007

Finalmente arrumei o feed RSS deste blog. Eu nem sabia que havia problemas, e o Berna me avisou que só estava recebendo os links do del.icio.us…

Bem, o problema todo estava no redirecionamento para o Feedburner. Mas já deve estar resolvido.

HD do Macbook consertado…em menos de 6 horas

Tuesday, January 16th, 2007

Ontem postei sobre a falha do HD, pois bem, claro que a máquina estava na garantia (1 ano), levei a Apple Store aqui no centro, fui atendido e o cara diagnosticou que o HD tinha ido pro espaço mesmo. Disse que ia demorar 2-3 dias, que me ligariam quando estivesse pronto. Fui para o trabalho, 4 horas depois me ligam:  “Está pronto”. Fantástico. Eu pago na boa por um serviço excelente assim. Claro que não me cobraram nada, só tive que ir buscar de noite.

O melhor do blog é a qualidade da audiência

Tuesday, January 16th, 2007

Acho que o melhor deste blog é quem lê e acompanha o que eu posto aqui. Não tenho link deste blog em lugar nenhum, todos que chegam aqui é porque ficaram sabendo por alguém. Portanto sempre há comentários bons, construtivos, de gente querendo participar.

Claro que acabei de começar, mas pretendo continuar da mesma maneira, deixando ele meio “stealth”, quem lê acaba me conhecendo, provavelmente é blogueiro mesmo.

O HD do Macbook morreu…

Sunday, January 14th, 2007

Hoje cheguei em casa e fui conferir as notícias no sofá, com o Macbook. Abri o notebook e o MacOS despertou, mas o HD ficou fazendo ruídos estranhos – “click, click”. Já na hora percebi que estava com um problema sério. Fiz um hard reset e nada de boot; ele não reconhece mais o HD.

Primeira coisa que eu fui ver era o recibo da compra, para saber se estava na garantia ainda: ainda não fez um ano, e este tipo de defeito é coberto. Amanhã cedo vou na Apple Store ver o que eles podem fazer, espero que não tenham que enviar o notebook para conserto.

A outra preocupação é sempre com os dados que estavam no notebook. Graças ao Foldershare, que roda no Macbook, no desktop de casa e nos 3 desktops do trabalho, todos os dados estão sempre sincronizados, ainda bem. Altamente recomendado, roda no Windows e MacOS. Além disto, só por garantia estou fazendo backup automático para o Mozy, assim tenho mais um nível de segurança.

Meu novo vício

Thursday, January 11th, 2007

Graças ao CC, eu comecei a assistir Heroes ontem. Acabei vendo 6 episódios via iTunes em uma noite…hoje quero mais.

Quem não assiste não sabe o que está perdendo. Coisa fina.

Não vou mergulhar no iPhone

Tuesday, January 9th, 2007

Dá uma vontade violenta de comprar o iPhone, mas achei demais o compromisso:
- US$499 na versão mais barata
- cancelar meu contrato com a T-mobile (e pagar a multa de US$150)
- mudar de número de telefone
- entrar em outro contrato de 2 anos
- comprar um dispositivo complexo de 1a geração

Desculpa, Apple, mas vou deixar esta passar. Vou guardar meu dinheiro para qualquer outra coisa…

Porque bloquear os provedores ?

Monday, January 8th, 2007

O tal bloqueio ao YouTube continua a ganhar complexidade. O que eu não entendo é: sendo o alvo da justica o YouTube, porque não ordenarem o site a rejeitar conexões do Brasil ? Seria o mesmo que obrigar uma companhia elétrica a desconectar a energia de casas com televisão para bloquear um programa de TV “bloqueado” pela justiça.

Será que a justiça está com medo de peitar o Google ?